Hi! I am using JunctionSeq first time and not very expert in R language. While running JunctionSeq analysis I am getting an error in reading decoder file. Here is the command and error:
"#Read the decoder:
decoder.file <- system.file("~/R/Splicejunction/annoFiles/decoder.bySample.txt",
package="JunctionSeq");
decoder <- read.table(decoder.file,
header=TRUE,
stringsAsFactors=FALSE)"
"Error in read.table(decoder.file, header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE) :
no lines available in input
In addition: Warning message:
In file(file, "rt") :
file("") only supports open = "w+" and open = "w+b": using the former"
Any help is much appreciated.
Thanks CS
•
written
by
sc@791 •
5 answers
Basaksehir nakliye , basaksehir nakliyeciler,basaksehir nakliye firmaları,basaksehir nakliyat,basaksehir nakliyat evden eve ,başakşehir nakliye şirketi,basaksehir nakliye fiyat,İstanbul başakşehir nakliye,başakşehir şehirler arası nakliyat,basaksehir evden eve nakliye,basaksehir evden eve nakliyat firmaları, başakşehir evden eve taşımacılık , başakşehir evden eve nakliyat fiyatları, başakşehir evden eve nakliye,başakşehir evden eve http://www.basaksehirevdeneve.com/
Basaksehir nakliye , basaksehir nakliyeciler,basaksehir nakliye firmaları,basaksehir nakliyat,basaksehir nakliyat evden eve ,başakşehir nakliye şirketi,basaksehir nakliye fiyat,İstanbul başakşehir nakliye,başakşehir şehirler arası nakliyat,basaksehir evden eve nakliye,basaksehir evden eve nakliyat firmaları, başakşehir evden eve taşımacılık , başakşehir evden eve nakliyat fiyatları, başakşehir evden eve nakliye,başakşehir evden eve http://www.basaksehirevdeneve.com/
İkitelli nakliyat,ikitelli nakliye,ikitelli nakliyeciler,ikitelli nakliye firmaları,ikitelli nakliye fiyatları,ikitelli nakliye firması,ikitelli kamyonet nakliye ,ikitelli nakliyat firmaları, ikitelli nakliyat fiyatları,ikitelli nakliyat firmaları,ikitelli nakliyat iletişim,ikitelli evden eve nakliyat fiyatları,ikitelli evden eve ,ikitelli ev taşıma,ikitelli evden eve nakliye,ikitelli evden eve taşımacılık http://www.ikitellinakliyat.net/
Hadimkoy nakliyat,hadımköy nakliye,hadımköy nakliyeciler,hadımköy nakliye firmaları,hadımköy nakliye fiyatları,hadımköy nakliye firması,hadımköy kamyonet nakliye ,hadımköy nakliyat firmaları, hadımköy nakliyat fiyatları,hadımköy nakliyat firmaları,hadımköy nakliyat iletişim,hadımköy evden eve nakliyat fiyatları,hadımköy evden eve ,hadımköy ev taşıma,hadımköy evden eve nakliye,hadımköy evden eve taşımacılık http://www.hadimkoyevdenevenakliyat.net/
Esenkent nakliye , esenkent nakliyeciler,esenkent nakliye firmaları,esenkent nakliyat,esenkent nakliyat evden eve ,esenkent nakliye şirketi,esenkent nakliye fiyat,İstanbul esenkent nakliye,esenkent şehirler arası nakliyat,esenkent evden eve nakliye,esenkent evden eve nakliyat firmaları, esenkent evden eve taşımacılık , esenkent evden eve nakliyat fiyatları, esenkent evden eve nakliye,esenkent evden eve http://www.esenkentevdenevenakliyat.com/
Log in to answer this question.
-
upload sc rna seq file into R
written by sandy •
-
R: data.table::fread error when converting MAF files to data table
written by melissachua90 •
-
How to resolve the warning message in detectRUNS on R software
written by taniamahmood38 •
-
Gene enrichment analysis R studio error
written by iamsmor •
-
scimpute problem: error in read table
written by hsu •
-
File open mode error in R
written by dengziqi1234 •
-
error for toGRanges
written by jolin0701-dy
-
using R4RNA package in R
written by dnyanepooja138 •
-
Getgeo Error
written by nazaninhoseinkhan
-
Seqinr Cannot Recognize ">" Character In File
written by Partha •
Maybe problem is the file permission of decoder.file. Try 'chmod 755 ~/R/Splicejunction/annoFiles/decoder.bySample.txt', then run JunctionSeq command.